Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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