Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IKZF1Q13422 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms