Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CBX3Q13185 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CBX3Q13185 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CBX3Q13185 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CBX3Q13185 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CBX3Q13185 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CBX3Q13185 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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