Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms