Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms