Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 OR4C15-201ENST00000314644 1113 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms