Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CHRNB3Q05901 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNB3Q05901 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms