Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms