Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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