Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms