Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRPF1P55201 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms