Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms