Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4P46934 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms