Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP13P45452 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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