Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
SPRR1AP35321 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.4 ms