Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GJA4P35212 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms