Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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