Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms