Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms