Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms