Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN1P18031 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms