Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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