Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFTRP13569 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFTRP13569 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms