Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETSIPP0DME0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms