Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX6O95503 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX6O95503 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX6O95503 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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