Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms