Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SUPT5HO00267 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUPT5HO00267 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms