Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NEDD8-MDP1E9PL57 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NEDD8-MDP1E9PL57 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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