Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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