Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms