Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KPZ7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KPZ7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KPZ7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KPZ7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KPZ7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC080079.1-201ENST00000509326 1045 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 CLEC4C-205ENST00000542353 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KPZ7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AL049536.1-202ENST00000623572 455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KPZ7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms