Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms