Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms