Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms