Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms