Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS4Q9NRS4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS4Q9NRS4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS4Q9NRS4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMPRSS4Q9NRS4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms