Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FANCFQ9NPI8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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