Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms