Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms