Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms