Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SEMA6DQ8NFY4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SEMA6DQ8NFY4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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