Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C17orf47Q8NEP4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C17orf47Q8NEP4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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