Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC16Q8NEE8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms