Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms