Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms