Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA3Q53S33 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms