Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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