Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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CDO1Q16878 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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