Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FSCN1Q16658 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms