Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms